Налогообложение доходов физических лиц, регулируется нормами 23 главы второй части Налогового кодека Российской Федерации. 
  Ставка налога устанавливается в размере 13% — с доходов физических лиц являющихся налоговыми резидентами, 30% — с доходов физических лиц не являющихся налоговыми резидентами. Налоговыми резидентами являются физические лица фактически находящиеся на территории Российской Федерации не менее 183 дней в календарном году.
  Особенности определения налоговой базы, исчисления и уплаты налога на доходы по операциям с ценными бумагами и операциям с финансовыми инструментами срочных сделок, базисным активом по которым являются ценные бумаги, предусмотрены ст. 214.1 Налогового кодекса РФ.
  В соответствии с названной статьей налогообложению подлежат доходы, полученные по следующим операциям:
купли-продажи ценных бумаг, обращающихся на организованном рынке ценных бумаг;
купли-продажи ценных бумаг, не обращающихся на организованном рынке ценных бумаг;
с финансовыми инструментами срочных сделок, базисным активом по которым являются ценные бумаги (под такими финансовыми инструментами срочных сделок, понимаются фьючерсные и опционные биржевые сделки);
с ценными бумагами и финансовыми инструментами срочных сделок, базисным активом по которым являются ценные бумаги, осуществляемым доверительным управляющим в пользу учредителя доверительного управления (выгодоприобретателя).
купли-продажи инвестиционных паев паевых инвестиционных фондов, включая погашение.
  Законодателем установлены особенности определения налоговой базы в зависимости от того, к какой из двух категорий относятся ценные бумаги: 
ценные бумаги, обращающиеся на организованном рынке ценных бумаг; 
ценные бумаги, не обращающиеся на организованном рынке ценных бумаг. 
  В целях налогообложения, согласно п. 3 ст. 214.1 НК РФ к ценным бумагам, обращающимся на организованном рынке, относятся бумаги, которые допущены к обращению у организаторов торговли, имеющих лицензию федерального органа.
  Для расчета налоговой базы в отношении доходов от операций с ценными бумагами определяется доход (убыток) по каждой сделке купли-продажи ценных бумаг. 
  Для определения дохода (убытка) по сделке купли-продажи ценных бумаг принимаются следующие показатели: 
сумма, полученная от реализации ценных бумаг; 
сумма расходов на приобретение, реализацию и хранение ценных бумаг, фактически произведенных и документально подтвержденных. 
  Доход (убыток) по сделке купли-продажи ценных бумаг определяется как разница между суммами, полученными от реализации ценных бумаг, и расходами на приобретение, реализацию и хранение ценных бумаг, которые фактически произведены и документально подтверждены. 
  В состав расходов, связанных с приобретением, реализацией и хранением ценных бумаг, включаются: 
суммы, уплачиваемые продавцу в соответствии с договором; 
оплата услуг, оказываемых депозитарием; 
комиссионные отчисления профессиональным участникам рынка ценных бумаг; 
биржевой сбор (комиссия); 
оплата услуг регистратора; 
сумма процентов, уплаченных за пользование денежными средствами, привлеченными для совершения сделки купли-продажи ценных бумаг, в пределах сумм, рассчитанных исходя из действующей ставки рефинансирования Центрального банка РФ;
другие расходы, непосредственно связанные с куплей, продажей и хранением ценных бумаг, оплачиваемые за услуги, оказываемые профессиональными участниками рынка ценных бумаг в рамках их профессиональной деятельности; 

Суммы полученных убытков по одним категориям сделок не принимаются в уменьшение дохода по сделкам других категорий. 

Например:
  Совершены две сделки c ценными бумагами.
  Первая сделка — обращающиеся на организованном рынке акции. Сумма, полученная от реализации акций, составила 150 000 рублей, а расходы, связанные с их приобретением, составили 120 000 рублей.
  Вторая сделка — не обращающиеся на организованном рынке акции. Сумма, полученная от реализации акций, составила 100 000 рублей, а расходы, связанные с их приобретением, составили 120 000 рублей.
  По первой сделке получен доход 30 000 руб. По второй сделке получен убыток 20 000 руб.
  Сумма убытка по второй операции не принимается в уменьшение дохода по первой сделке. Налоговая база по операциям с ценными бумагами составит 30 000 руб.
  Кроме того, при расчете налоговой базы по операциям с ценными бумагами следует учитывать, что:
 - по ценным бумагам, обращающимся на организованном рынке, размер убытка определяется с учетом предельной границы колебаний рыночной цены ценных бумаг, в размере 19,5%, установленной распоряжением Федеральной комиссии по рынку ценных бумаг от 05.10.98 N 1087-р.

Например:
Цена приобретения ценных бумаг 100 руб.
Цена реализации ценных бумаг (без учета расходов по оплате услуг по реализации ценных бумаг) 60 руб.
Рыночная средневзвешенная цена ценных бумаг, зафиксированная в день реализации 80 руб.

  Исходя из приведенных данных определяем:
нижняя граница колебания рыночной цены в указанный день 80 — (80 х 0,195) = 64,4;
убыток от реализации ценных бумаг за пределами нижней границы колебания рыночной цены, не принимаемый на уменьшение налоговой базы, 64,4 — 60 = -4,4.
убыток от реализации ценных бумаг в пределах нижней границы колебания рыночной цены, принимаемый на уменьшение налоговой базы, 100 – 64,4 = 35,6.
  Ст. 220 Налогового кодекса предоставляет налогоплательщику право воспользоваться имущественным налоговым вычетом вместо документального подтверждения расходов. Предусмотрен следующий размер имущественного вычета:
в размере 125 000 рублей от имущества находящегося в собственности менее трех лет; 
в размере полной суммы, полученной от реализации ценных бумаг, находящихся в собственности три года и более.
  Если физическое лицо подтвердило документально расходы на приобретение ценных бумаг соответствующей категории, и воспользовалось вычетом расходов при определении налоговой базы, имущественные налоговые вычеты, указанные в п.п. а) или б), данному физическому лицу не предоставляется.
  Право на имущественный вычет предоставляется только физическим лицам, являющимся налоговыми резидентами Российской Федерации. Для нерезидентов налоговая база может уменьшаться только на расходы, связанные с совершением операций с ценными бумагами и финансовыми инструментами срочных сделок, подтвержденные документально. 
  Для освобождения от двойного налогообложения доходов гражданина, который не является налоговым резидентом РФ, предусмотрено обязательное выполнение следующих правил:
гражданин должен предоставить в российский налоговый орган документ, подтверждающий, что он является налоговым резидентом государства, с которым Россия заключила договор (соглашение) об избежании двойного налогообложения;
гражданин — налоговый резидент указанного государства должен предоставить в российский налоговый орган документ иностранного налогового органа о сумме дохода и налога, уплаченного им за пределами России.
  Профессиональные участники рынка ценных бумаг, через которых физическое лицо совершает операции с ценными бумагами и которые являются источником выплат физическому лицу полученного дохода, являются налоговыми агентами. Исполняя функции налоговых агентов, проф. участники обязаны исчислять, удерживать и оплачивать в бюджет налог на доходы физических лиц, полученные от совершения операций с ценными бумагами. 
  Налоговый период по налогу на доходы физических лиц составляет календарный год.
  В случае если налоговым агентом выплачиваются денежные средства до истечения очередного налогового периода, налог уплачивается с доли дохода, передаваемого физическому лицу. Доля дохода физического лица определяется как произведение общей суммы дохода по операциям с ценными бумагами с начала года на отношение суммы выплаты к стоимости оставшихся на счете ценных бумаг.